カズヤは人類の敵ノヴァと戦うためゼネティックスへと編入し、そこで今は亡き姉と似た少女サテライザーと出会う。
幾多の闘いを越えて徐々に近づいていく二人――。
激化をたどる戦いの中、人類は新たな選択を決断した。
先天的資質に頼っていたパンドラの確保を人の手で行おうというのだ。
エボリューション・パンドラプロジェクト――通称"Eパンドラ計画"が発動。
それは、人類に未来をもたらす福音たりうるのか!?

第53話 零下の大地
第54話 パンドラVSパンドラ
第55話 実力の差
第56話 地を這う者達
第57話 マークⅣ
第58話 スカーレット＝大原
第59話 生け贄の代償